全國8到12萬戶的獨資合夥大店戶每年都要先繳營所稅，再於綜所稅中退稅，不堪其擾，賦稅改革委員會已達共識，由財政部修法，大店戶免繳納營所稅，直接歸課個人綜合所得稅，獨資合夥人將可省資金積壓的利息。所謂獨資合夥是指「非公司組織」的營利事業；大店戶是指「每月營業額在20萬元以上」，例如餐廳。
由於所得稅法只有排除每月營業額在20萬元以下的小規模營業人不必申報營所稅 ，大店戶要報繳營所稅及綜所稅。往往造成大店戶獨資合夥事業在5月申報繳納營所稅，在二稅合一下，已納營所稅又可以扣抵個人的綜所稅，所以造成同年7月31日又可以得到綜所稅的退稅，手續繁雜，民怨不斷。