2017-01-09 21:27聯合報 記者王宏舜╱即時報導
翁啟惠和張念慈在美成立Optimer公司，但翁因返台擔任中研院基因體研究中心主任而辭去該公司科技諮詢主委、董事職位。2010年Optimer執行長Pedro，參訪中研院後對中研院實驗室讚譽有加，曾提供30萬美金給翁啟惠在美的Scripps實驗室，調查局也依不違背職務受賄罪移送翁。士檢認為此部分證據不足，不起訴。
美國Optimer Pharmaceuticals公司原是翁啟惠、張念慈和友人Samuel於1999年設立，執行長Pedro在翁啟惠擔任中研院院長期間曾來台參訪，高度讚賞中研院的設備和研發能力，亟想和中研院合作，返美後即請人和翁聯繫，討論合作可能性。
翁個人在美設立的Scripps實驗室因資金短缺，翁啟惠在2011年3月寫信給Optimer人員，表達想將Scripps研究室納入Optimer合作，Optimer公司臨床開發副總許友恭回覆「會提供經費」。
但Pedro對「想和中研院合作、為什麼付錢給Scripps」有疑問，翁啟惠卻語帶威脅向許表示「如果不能維持我的實驗室，我們將停止中研院與Optimer合作的討論」，當年7月Optimer捐贈30萬美金給Scripps實驗室。
士檢認為Optimer在捐款後，翁啟惠並未以中研院院長身分介入Optimer與中研院的合約談判，且因翁認為中研院需負責高通量篩選法工作，成本較高，還通知Optimer調高分配給中研院費用、降低給Scripps的金額，如果他有以職務上行為收受賄賂故意，沒必要主動表示要減低捐款。