生菌數及大腸桿菌群常被用來作為監測食品是否遭受污染，或是製程有無衛生缺失的重要指標之一，食品中檢出生菌數、大腸桿菌群過多，雖不致於影響身體健康直接致病，卻足以顯示該產品衛生狀態不良。
因三明治並不需再加熱即可食用，衛生程度需要特別注意，雖便利商店販售之三明治多存於較低溫的環境，微生物較不容易生長，但若受到操作環境及人為汙染，或是配料處理不當（如生菜清洗、內餡烹調等）及儲存設備不當使溫度升高，都易使微生物大量繁殖而超出標準。因此，對於商品整個製作流程的每個環節、操作人員的衛生狀況，製造廠商應加強控管。另外，販售商也應注意商品儲存設備的溫度控制是否異常，商品經運送車送來後也應儘快上架，以降低商品受到微生物汙染及孳生的機會。
新北市政府衛生局呼籲業者應落實衛生自主管理，重新審視製售衛生。並提醒民眾，購買三明治等食品，應選擇商譽良好、販售場所整潔衛生的店家，所購買食物注意色澤及氣味是否正常，購買後應立即食用完畢，以避免細菌孳生。