3、4日暴雨，農委會彙整各直轄市、縣市政府查報資料，截至6日傍晚5時，農業產物及民間設施估計損失計新台幣1億6352萬元，損失最重縣市，由雲林縣轉換成南投縣。
原本農損縣市受損最嚴重是雲林縣，換成南投縣。農委會分析，南投縣損失4030萬元，占全國農損金額的25%，第二是雲林縣損失2879萬元、占18%，第三是新北市損失2032萬元、占12%、第四是台東縣損失1674萬元、占10%，第五是宜蘭縣損失1633萬元、占10%。
依產業別統計，「農產損失」1億1208萬元，含養蜂損失近6萬元，農作物被害面積4136公頃，損害程度15%，換算無收穫面積619公頃；受損作物主要為西瓜，被害面積365公頃，損失金額2241萬元，次為一期水稻、薑、太空包香菇及食用番茄等。
「畜產損失」947萬元，主要是雞、鵝及豬受損。「漁產損失」176萬元，主要是鱒魚及鱘魚受損。
此外，「民間設施損失」4020萬元，包含兩大類，1.農田流失及埋沒估計損失金額4006萬元，主要是台東縣、新北市、南投縣及高雄市等農田流失及埋沒計42.79公頃。2.農業設施估計損失金額14萬元，主要是嘉義縣、南投縣及雲林縣受損。
農委會並已公告新北市、台中市、彰化縣、南投縣、雲林縣及嘉義縣為辦理現金救助地區及辦理低利貸款地區。