頭痛起因很多，在臨床上，多依據病史做診斷，包括年齡、性別、職業或家族史都有可能：
■ 叢集性頭痛
臨床上少見，容易被誤診，無家族史，以男性為主且多於年輕時發病。在發作期會反覆短暫單邊頭痛發作且有週期性，發作間期約30分鐘至數小時，一天發生2～3次。且伴隨流鼻水、流眼淚，常被誤以為是偏頭痛或鼻竇炎。固定在每年秋冬季發作，發作典型為夜間定時劇烈頭痛，乙醯胺酚類止痛藥（如普拿疼） 常無法止痛且抽菸易加劇頭痛。
■ 壓力性頭痛
是慢性頭痛中最常見的一種，壓力性頭痛之發生與情緒有關，主要是精神壓力和姿勢不良，病患的兩額側、後枕部、頭頂部或整個頭部出現漲痛、鈍痛。有時會發現頸肩部肌肉有壓痛點，有時可以摸到一個或多個肌肉硬結。發作間期比較長，而且越來越痛。
■ 典型偏頭痛
好發年輕女性族群，可能與賀爾蒙有關，一般有明顯家族史，頭痛可能與酒精、缺氧、及情緒及有關。偏頭痛的病史一般都很長，會在單一次發作間期約1～72小時內反覆發作及緩解。
偏頭痛大部分發作是一側太陽穴，但是三分之一的人發作也可以是兩側，如果你有嚴重到需要休息、會噁心想吐、發作時看到光線不舒服，三項症狀之中兩項或三項皆有，90%以上的機會，你的頭痛是偏頭痛。
■ 老年人的頭痛
常與高血壓有關，顳動脈炎，也是老年人頭痛常見的原因，須多加小心。
■ 職場暴露在有毒物質環境
如一氧化碳、 鉛、氮化物下，也會引發頭痛。
■ 突發性頭痛合併有神經症狀
要考慮自發性蜘蛛膜下腔出血或腦膜炎。
■ 創傷後頭痛
三個月內的頭痛，常常與遲發性腦出血或硬腦膜下積液相關，過長的發作間期，要考慮不是因為腦部損傷所引起的。
■ 須立即就醫的頭痛警覺
• 任何突發爆炸性的頭痛，從來沒那麼痛過。
• 以前從未頭痛，現在會突發的頭痛，而且越來越痛。
• 伴隨發燒、抽筋、意識變化、昏迷或手腳癱瘓的頭痛。
• 從睡夢中痛醒、早晨醒來會頭痛，並伴隨有嘔吐。
• 以前有頭痛，但痛的型態改變。
• 年紀大（超過50歲）才第一次發生頭痛。
• 咳嗽、用力或彎腰會增加的頭痛。
• 伴隨頸部僵硬的頭痛。
• 小孩反覆發生的頭痛
• 伴隨著眼睛痛或耳朵痛的頭痛。
• 運動後的頭痛。
• 頭部撞擊後之嚴重頭痛。