重新開徵「證所稅」的同時，緊接來到的是「期所稅」的新衝擊。基於市場衡平性原則，財政部考慮將納入課徵證所稅的一般法人，在期貨市場的交易所得，一併納入課稅範圍。
台灣從未對期貨交易課徵所得稅，但個人及法人買賣期貨，政府會對買賣雙方，各課徵一筆期貨交易稅。據指出，規劃中的期貨交易所得課稅方式，將比照證券交易所得處理，兩者並可互抵盈虧，按總所得以結算申報的方式，課徵所得稅。
考慮開徵「期貨交易所得稅」，主要是因為目前的期貨商品，包括股價類期貨契約，或股價指數類的期貨，投資標的都與證券相關，如果股票等現貨交易的所得，必須課徵資本利得稅，期貨市場的交易所得若仍保有免稅的狀態下，不僅會使市場失衡，也會導致法人的資本利得稅負失真。
市場人士表示，法人證券交易所得若確定要課稅，期貨交易所得稅即不能維持免稅。據指出，有市場人士向財政部建議，應同步考慮證所稅與期所稅的徵免問題，期貨市場通常是股票現貨市場避稅工具，例如，在現貨市場看空的人，在期貨市場即會反向操作，藉此降低風險。
若只課徵證所稅卻讓期貨交易維持免稅，同一個金主在不同市場出現賺賠時，就會出現實際總所得無法真實呈現的困擾。