馬祖亮島遺址中「亮島人」的發現，對於台灣是否為南島民族的起源地，提供了很有價值的信息。國立歷史博物館舉辦「南島溯源八千年─亮島人與馬祖史前文化展」，帶領觀眾了解發現亮島人的考古事件，展期至2015年1月25日止。
「亮島人」的發現源自2011年，國軍慶祝亮島登島60週年，期間意外發現多處貝塚，考古團隊更先後發現了2具完整的亮島人遺骸，此為台灣考古學上的重大發現，也是國內至今發現最早的人骨，同時更是中國大陸東南沿海新石器時代早期墓葬中，少數年代久遠且保存良好的案例之一。這次展出的「亮島人1號」與「亮島人2號」的頭骨，及「亮島人1號」出土時的「屈肢葬」墓葬當時全貌，因避免破壞而以3D同尺寸複製展出，其餘展品包括陶石器、骨角器等，全為真跡。