防疫專家觀察，相較鄰近國家對疫情的處置，例如日本政府遲至1月28日才宣布武漢肺炎為「指定感染症」，強制要求感染武漢肺炎者住院治療，並要求患者在期間內停止工作，台灣政府對於疫情的判斷及決策，顯然較有效率，並大幅超前，如登機檢疫、明定為法定傳染病，及提升旅遊疫情級別等3項決策，至今仍先於許多國家，或成為他國仿效的措施，是疫情不致擴大的關鍵。

對照我國政府從12月底疾管署率先召開首次專案小組會議，並且同天就宣布實施登機檢疫、針對從武漢入境旅客實施健康追蹤，並在1月15日就宣布武漢肺炎為法定傳染病，相較下，日本政府卻一直到1月28日，才宣布武漢新型肺炎為「指定感染症」。

依照日本的《感染症法》規定，指定感染症分為5類，如果感染這5類的指定感染症，政府有權可以強制民眾隔離就醫，並且可由政府預算支出相關經費，也規定可強制禁止進入職場工作等，但日本政府以基於「人道立場與維護人權」，針對撤僑的國民，只用「勸告」而非「強制」檢查與就醫；這些從武漢回到日本的國民，甚至有人自認身體健康，選擇自行返家，這些狀況也讓日本百姓對於安倍政府已經慢半拍的防疫工作，再度打上問號。

疾管署在1月15日正式公告「嚴重特殊傳染性肺炎（即武漢肺炎）」為第五類法定傳染病，依法必須通報；16日專家團返台，立即開記者會說明武漢疫情，判斷「人傳人的可能性很難被推翻」，疾管署當天還宣布提升武漢市的旅遊疫情到第二級警示，當時中國疾控中心對外通報的確診案例僅41例，鄰近各國完全未嚴正意識到即將隨之而來的風暴。