蔡政府上任後兩岸關係急凍，虱目魚契作也喊停，魚貨約近兩年價格不振，高雄市鑑於市場頗富潛力的鮪魚、秋刀魚、魷魚轉進泰國等地市場，產值已大幅提升，有意讓虱目魚循此模式進軍南向市場，漁業界對此樂觀其成，認為只要能打開銷路賺錢，西進、南向都好。
高雄、台南地區是虱目魚大宗產地，生產的虱目魚肥美質優，堪稱庶民美食，也是許多魚漿煉製品的上游原料。其中台南地區2011年至2015年連續5年與大陸契作，每台斤以40到45元的價格收購，比一般行情高約10元，市場曾是一片榮景，但國內政黨輪替後，契作關係停擺，價格直落，有民進黨籍漁友焚燒民進黨證洩憤。
高雄市彌陀區漁會總幹事林子清表示，兩岸關係丕變，契作關係幾乎歸零，即使有出魚，數量也極少。今年的魚價好不容易回穩到每公斤60元，供應內銷市場已不足，並不會再出魚到大陸，擺脫漁價低靡的影響。
林子清表示，台南與高雄兩地飼育方式不同，成本也不同，能與大陸契作，價格維持穩定，漁民當然較好控管成本，但沒有契作關係，也要自求多福，只要能增加魚貨外銷，不管南向或西進都好，只怕南向牽涉到關稅，恐怕沒那麼容易。
高雄市海洋局長林英斌表示，兩岸關係變化，不能說對虱目魚毫無影響，但虱目魚不是外銷大陸主要魚種，比起石班 ，衝擊相對較小。而石斑西進大陸受阻，回銷台灣引發的市連動影響，才是問題。
虱目魚這兩年的價格下滑，民意代表曾為此對高市海洋局提出質詢，不過林英斌表示，海洋局未停滯拓展市場的腳步，更持續帶績優廠商赴海外參加各種不同的食品展，爭取外銷訂單。上月底部分食品業者前往泰國參加食品展，發現高雄水產品頗獲當地喜愛，商機應有可為。
據高雄海洋局統計，鮪魚近年是出口泰國的冠軍水產，去年輸出泰國高達5.6萬噸，創造台幣28億的產值，其次魷魚、秋刀魚出口量也增加4倍，去年產值達6000萬。