勞基法規範，平日正常工時8小時以後，第9、10小時的加班，享有加班費1又1/3，第11小時以後的加班費提高至1又2/3，實務上，很多事業單位將加班費換成補休，勞工從原來享有1又1/3、1又2/3加班費變成僅有1小時補休，立委林靜儀質疑，不公平，對此，勞動部承諾，之後全面考量。
加班費未依比例換補休部分，自一例一休通過前，勞團就在多場勞部舉行的公聽會上抗議，勞團訴求，加班費應該依比例兌換，而非用時數一比一換算。勞動部前部長郭芳煜也曾在立院質詢時說，用補休方式代替加班費不公平，近期會檢討。但是隨著部長換人，加班費依比例換補休都沒下文。
立委衛環委員會今質詢勞動部，立委林靜儀再度提及加班費依比例換補休議題，林靜儀說，事業單位為了減省加班費，都給予勞工補休，勞工補休累積達一定量，又無法休完，真正想拿加班費拿不到、想補休也無法休。
林美珠回應，確實有疑慮，現行勞基法，平日、國定假日加班費計算方式多元，之後將會做全面考量。
另外，立委衛環委員會召委蔣萬安也已經提案，將加班費依比例兌換補休納入一例一休修法中，保障勞工權益。