匈牙利四日開放邊界，讓中東難民前往奧地利和德國之後，逾萬名難民在五日和六日抵達奧地利和德國城市，其中約一萬兩千人去了德國巴伐利亞邦首府慕尼黑，難民在車站受到當地民眾的熱情歡迎，但巴伐利亞邦執政的保守聯盟卻砲轟總理梅克爾對難民開綠燈，是「釋出錯誤的訊號」，梅克爾六日召開政府內部會議，商討難民危機。
大約六千八百名難民五日搭乘免費的高速火車抵達慕尼黑，六日估計又湧入五千多人。難民一下火車看到當地民眾舉著歡迎的氣球、奉上糖果，並送給兒童玩具，許多難民感動落淚。
卅二歲的敘利亞難民默罕莫德的眼裡閃著淚光：「這裡的人待我們真好，把我們當成人來對待，不像在敘利亞。」
守在法蘭克福火車站的民眾徹夜高呼：「讓我們大聲說，清楚地說，我們這裡歡迎難民。」
但梅克爾所屬的基督教民主聯盟在巴伐利亞邦的姊妹黨基督教社會聯盟，不滿梅克爾沒和各邦商量，就決定收容這麼多難民，並批評是「錯誤的決定」。
梅克爾五日與匈牙利總理奧班通電話，商定上周末對難民開綠燈是例外，僅此一次，之後要執行歐盟的都柏林協定，也就是難民必須在進入歐盟的第一個國家登記和申請庇護。
自從三歲男童亞藍溺死照片傳開後，西歐民意轉向歡迎難民。天主教教宗方濟各六日呼籲，歐洲每個天主教教區、每個宗教團體、每個修道院、每個聖所收容一個家庭，梵蒂岡兩個教區將以身作則，「在未來幾天內」接納兩個難民家庭。
歐洲歡迎難民的動能是否能持續？法國各地也有支持難民的遊行，大約八千五百人五日走上巴黎街頭，手持「歡迎難民」標語。但六日民調顯示，百分之五十五的法國人反對放寬難民規定。
英國首相卡麥隆也在民意壓力下，考慮收留一萬五千名難民。但英國六日公布的民調，支持英國脫離歐盟的比率首度超過反對者，百分之四十三受訪者表示將在二○一七年的公投投贊成脫歐，百分之四十反對。