中醫是神傳醫學，這一點從經絡、穴位的體現最為明顯。現代醫學認為經絡穴位看不到，摸不著，但是確有臨床奇效。儘管現代醫學家（中醫師、西醫師）這麼解釋，那麼解釋，怎麼也解釋不清楚。為甚麼呢？因為它本來就是「超科學」，它是另外空間的東西。經絡、穴位和經氣運行實質存在於微觀空間。經絡的發現，與古代修煉人有關。中國古代名醫李時珍在《奇經八脈考》的序言中講：「內景隧道，唯返觀者能照察之。」此言必不謬也。
所謂「內景隧道」就是經絡，那麼「返觀者」指的是修行得道者。他開天目能透視人體內部，看到經絡縱橫交錯，四通八達。經絡有十二條，跟我們身體結構上的每個臟或腑有關，也都根據臟腑的名字而有其名。這就是「十二經絡」，它們的名稱就是：「肝經、心經、脾經、肺經、腎經、心包經、膽經、小腸經、胃經、大腸經、膀胱經還有三焦經。」另外還有「奇經八脈」：「任脈、督脈、陰蹺脈、陽蹺脈、陽維脈、陰維脈、帶脈、衝脈。」
十二條經絡各有自己所屬的陰、陽，以臟為名的叫作「陰經」，以腑為名的叫作「陽經」。陰經有六條，在手足各有三，即足三陰、手三陰；陽經也有六條，在手足也各有三，即足三陽、手三陽。陽經又被分成太陽、陽明、少陽，陰經又被分成太陰、少陰、厥陰。
「手三陰經」從胸走到手，「手三陽經」是從手走到頭，「足三陽經」從頭走到腳，「足三陰經」從腳走到胸部，這種循經之氣在身上的運行方式，在針灸學的應用上有很重要的參考作用，例如手太陰肺經及手陽明大腸經的經絡循行如下圖。順著經的走向針刺，是補針的刺法；而逆著經的走向而針刺，就是瀉的刺法。
一陰經和一陽經互為表裡經，如肺經和大腸經互為表裡經；心經和小腸經互為表裡經；心包經和三焦經互為表裡經；脾經和胃經互為表裡經；腎經和膀胱經互為表裡經；肝經和膽經互為表裡經。而且經和經之間有橫向的「絡」，每一對互為表裡的經都有一個絡穴相連，在兩個經之間互相連絡著。因為有十二經，每個經又各有一絡，所以有十二絡。除了十二個絡之外，任、督兩脈也各有一絡，再加上一個「脾之大絡」，一共有十五絡，所以在中醫的學術上稱，「經有十二、絡有十五」。中醫理論又認為，在人體的經絡上有很多氣血輸注出入之處，就像一個個小孔一樣，它們就是穴位，「腧」讀作「輸」具有轉輸及疏導的意義，「穴」即「孔」的意思，因此腧穴即經絡上的連接站。