自富邦台50（006208）下調管理費，同樣追蹤台灣50指數的元大台灣50（0050）常常被拿來比較，最常見的文章不外乎以特定時間、特定的報酬率來指稱006208較優；日前某文章更比較，該兩檔ETF若於近兩年定期定額，0050表現大輸，但經法人了解，其實是比較系統「出錯」，調整後轉而由0050獲勝。

至於管理面上，自從006208砍價，績效確實提升，惟論規模和成交量，尚在追趕0050的路上，兩檔ETF的追蹤誤差和股價表現展現不同成績，專家建議投資人仍應「多」指標齊下，包括市場上常單論「股價」來挑低價者，也是很粗糙的推薦法。