由於CPTPP最大成員國日本也是台灣眾多國產車合作的對象，汽車業界擔心台灣加入後，未來國產車恐大量被日本進口車取代。

台灣區車輛公會正研擬說帖，預計跟政府爭取時間，提出三大配套辦法，拉長整車進口關稅降到零的時程，以及補助業者在新技術研發與新產品開發的研發經費，避免台灣汽車產業消失的可能性。

如果真的加入CPTPP，台灣汽車產業長期恐怕受創嚴重。包括Toyota、Nissan、Honda、Mitsubishi等國產車品牌合作對象都是來自日本的母公司，台灣加入CPTPP之後，預期長期關稅將降到零，影響所及在台組裝成車的業者包括國瑞汽車、中華車、裕隆、本田都可以因為大量日本車直接進口而遭受嚴重衝擊，甚至美系品牌福特汽車也難以避免受到打擊。

對於加入CPTPP對台灣汽車產業的影響，福特汽車指出，影響程度和業者的生存空間要看政府加入的條件和生效的時間表。

汽車業者指出，業界認為台灣不可能放棄汽車產業，加入CPTPP也是勢在必行。車輛公會目前也正在研擬提出三策略，向政府爭取汽車產業的空間。

目前公會計畫提出的方案是：一、延長汽車進口關稅降到零的時間，讓業者有足夠的時間可以對應。

二、如果汽車產業長期進口關稅降到零，汽車零組件的關稅稅率更要加速降低，才不會形成對台灣汽車產業的懲罰。

三、為政府對汽車新技術開發的獎勵協助以及補助本國產製相關製程的成本，這種關稅之外的策略目前南非也已採行，可以使本國產業有機會在加入CPTPP時，仍能具備一定程度的競爭力。