常吃深海魚真的會汞中毒嗎？恐有肌肉萎縮的現象？農委會水產試驗針對黃鰭鮪、巴鰹、鬼頭刀、皮刀、吳郭魚、鯖魚、花枝等水產物甲基汞、鉛及鎘之檢測結果顯示，其含量都低於衛福部法定限量標準，不過仍提醒，依照食藥署建議，敏感族群應注意大型迴游魚類的食用量。
水試所指出，魚肉是很好的蛋白質來源且含有 ω-3 系列脂肪酸，例如 EPA （Eicosapentaenoic acid，二十碳五烯酸）及 DHA （Docosahexaenoic Acid，二十二碳六烯酸）；依據食藥署的「魚類攝食指南」建議孕婦及育齡婦女每週應均衡攝取7到9份魚類，但對於大型洄游性魚類則應留意食用量，每周宜以1份(約35克)為度。
專家則指出，汞含量的多寡與海水的深度無關，和食物鏈的位階才有關係，像是鯊魚、鮪魚、旗魚、鯨魚、油魚等大型掠食性魚類，都是位於食物鏈的頂端，靠吃小魚維生，體內累積的汞含量相對較多。