流感疫情造成部分醫學中心急診壅塞，加護病床、葉克膜吃緊，衛福部及各地衛生局已指定26家「應變醫院」，適時分流重症病患。
衛福部表示，截至今天(4日) 中午12時為止，急診等待加護病床人數超過5人的醫院共計有奇美、成大、中榮、林口長庚、高雄長庚、嘉義基督教等6家醫學中心，其中4家醫院已自行調整病床使用，成大及嘉義基督醫院則啟動轉診機制，將等待的病患轉至其他流感應變醫院，以改善急診擁擠狀況。
在葉克膜部分，衛福部說，全國36家重度級急救責任醫院共有32台葉克膜空機可用，至今日中午12時為止，醫院間自行調度8台，目前已無醫院需要葉克膜支援。另外，26家流感應變醫院，也共有18台葉克膜可用，必要時也可調度。
衛福部指出，將利用緊急醫療救護系統(EMS)掌握全國加護病床空床數，並每天與地方衛生局召開視訊會議，解決因流感疫情所造成的急診壅塞狀況，各地衛生局也會協助轄區急救責任醫院調度加護病床、葉克膜及醫療人力，以確保醫療量能，避免影響對其他患者的醫療服務。