林務局嘉義林區管理處巡查阿里山森林鐵路，發現58k未通車路段，出現2處大型災害，林管處表示，應該是受到杜鵑颱風影響，已通報台鐵局森鐵處進行勘災與修復。但原預估今年12月25日全線通車目標，已無法達成。 林務局嘉義林區管理處表示，奮起湖監工區道班人員於9月30日完成營運路線巡查及路線上崩落土石、樹木等清理，並完成試車，10月1日嘉義至奮起湖營運恢復正常。在未通車路段58K+710m處，發現有大型災害無法通過，兩處損壞合計約55米，現場邊坡仍不穩定，土石持續崩落中。
10月3日再度邀請專家現場勘查結果，在颱風豪大雨淘刷形成懸空的岩塊，處於不穩定狀態，且邊坡陡長險峻，尚無法立即處理，建議待天候穩定後再進行後續處理。
目前預估104年12月25日全線通車，因杜鵑颱風影響已無法達成，林務局嘉義林區管理處近期將評估由「奮起湖」車站延伸至「十字路」車站的可行性，再以汽車接駁，路程距離約10公里，乘車時間約25分鐘。