房地稅合一將成未來不動產交易課稅原則，財稅金融專家表示，土增稅採稅額扣抵制後，不動產交易可能會更貼近市價；會計師估算，民眾若賣屋1000萬元，因為交易價值不能藏在稅負較低的土地增值稅中，稅金可能要較現在多繳80萬元，豪宅、高所得者賣屋稅負更重，可能會引發新一波賣屋潮。
淨賺併入綜所稅核課
不願具名的稅務主管表示，目前房、地稅分離，以投資客若買進600萬元不動產估計，其中房屋、土地各300萬元，5年後以1000萬元處分，其中土地市價則漲至700萬元，房屋售價維持300萬元，不用課房屋財產交易所得；但土增交易部分依據現行土地公告現值漲價金額僅100萬元課稅，在土增稅稅率20%的估算下，只要繳交20萬元稅金。
不過若是新制上路，賣1000萬元不動產，扣掉買進成本600萬元以後，國稅局可能會認定投資客淨賺400萬元，全部併入綜所稅核課。
在沒有其他所得前提下，適用稅率30%，要繳120萬元稅金，但可扣掉20萬元土地增值稅，房地稅總額達100萬元，一來一回，總繳稅金多了80萬元。
安侯建業會計師張芷表示，若是房地稅合一課徵財產交易所得併入綜所稅核課，收入愈高的人課稅壓力會愈沉重。舉例來說，納稅人若已有其他收入，適用最高稅率45%，賣掉不動產交易金額達1500萬元，扣土增稅、規費以後淨賺300萬元，還是得另外核課135萬元稅金。