膠淋巴系統代謝腦內廢物的效率大幅下降，這使得與阿茲海默症高度相關的類澱粉蛋白等持續累積在大腦中，加速神經元受損，從而增加罹患失智症的風險。深度睡眠剝奪也容易導致大腦體積加速衰退縮減，特別是在中年人族群發現，長期有睡眠品質不佳、入睡或維持睡眠困難、或早醒者，其腦部年齡增加幅度明顯較大，可能比正常睡眠者老1.6至2.6歲。