台北市國稅局前後認定不一，爆發台肥(1722)補稅爭議，台肥副總經理許繼文昨（8）天指出，根據國稅局的認定，海外繳納過的所得稅不能在當年度扣抵，因而核定97年度與重核94年度預計要補稅5.64億元，如果按此一標準，最近5年總共要再補繳 20.32億元的稅額。面對前後不一致的認定，台肥決定先行申請複查。
不過，台肥補稅事件，是否引發目前企業在海外有轉投資的一連串補稅風波，備受關注。
許繼文指出，這起補稅案起因是台肥轉投資中東朱拜爾公司，從94年起陸續有獲利，當時台肥曾去函台北市國稅局要求說明，在中東當地有繳稅證明時，是否可以抵扣台灣的營所稅，並在95年2月26日獲得台北市國稅的覆函，認定重覆課稅部分可以抵扣，也因此，根據台北市國稅的認定辦理抵稅作業。
他說，不料，國稅稅在審查台肥97年度的營所稅時，突然審核標準180度大轉彎，認為先前的認定不對，並撤消先前的說法，逕行核定台肥必須補繳97年度的稅額5.28億元，同時國稅局也重新審核最近5年申請案，目前只就94年度的案件認定，要求補稅0.36億元，總計這次要補稅5.64億元。
許繼文強調，由於茲事體大，該公司正在採取應變措施，先行台北市國稅局申請復查。一旦這項認定標準無法改變，包括95年度、96年度與98年度在內，可能分別要補繳2.57億元、3.12億元與8.99億元，合計達14.68億元，連同已核定要補繳的稅額，總共高達20.32億元。
由於北市國稅局前後兩次的認定有重大差異，已對台肥的營運造成可能的重大衝擊，20億的補稅款，估計要吃掉台肥半年的盈餘。許繼文表示，是否要申請國家賠償，這是假設性問題，目前無法置喙，不過，台肥已有最壞的打算，也正在研擬相關因應對策，將衝擊降至最低。